【文件属性】:
文件名称:图像去噪中matlab代码贝叶斯阈值-NMF-Source-Extraction:用于CA源提取的NMF管道
文件大小:47.94MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-20 23:57:26
系统开源
图像去噪中matlab代码贝叶斯阈值钙成像数据的运动校正,去卷积和去混合
该代码实现了一种方法,用于同时从大型钙成像电影中进行信号源提取和峰值推断。
该代码适用于体细胞成像数据的分析。
将来将增加用于分析树突状/轴突成像数据的工具。
该算法在以下内容中有更详细的介绍
Pnevmatikakis,EA,Soudry,D.,Gao,Y.,Machado,T.,Merel,J.,...&Paninski,L.(2016年)。
同时对钙成像数据进行去噪,去卷积和去混合。
神经元89(2):285-299,
Pnevmatikakis,EA,Gao,Y.,Soudry,D.,Pfau,D.,Lacefield,C.,...&Paninski,L.(2014年)。
用于大规模钙成像数据分析的结构化矩阵分解框架。
arXiv预印本arXiv:1409.2903。
新增:运动校正
我们刚刚发布了用于NOn刚性运动校正的新工具箱。
您可以将其作为独立软件包与该软件包集成在一起,也可以将Python作为的一部分找到。
代码说明
最好的开始方法是查看各种演示。
:一个简单的演示,在仓库中包含一个小的数据集,