文件名称：DROMPAplus：ChIP-seq管道工具，用于对多个ChIP-seq样本进行质量检查，标准化，统计分析和可视化
文件大小：24.39MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-18 01:52:47
C++
DROMPAplus 1.概述 DROMPA（DRaw和观察多种浓缩曲线和注释）是一种ChIP-seq管道工具，可满足各种需求，包括质量检查，分析和多个ChIP样品的可视化。 DROMPAplus用C ++编写，具有许多有价值的功能。 DROMPAplus： 接受多种地图文件格式（SAM，BAM，CRAM，Bowtie，TagAlign（.gz））并读取分发格式（WIG（.gz），bigWig，bedGraph）。 支持加标归一化和总读取归一化。 输出用于ChIP-seq分析的各种质量指标。 以常规PDF格式可视化阅读分布； 因此，不需要额外的程序，对于许多用户而言，这是更理想的选择，尤其是在与生物信息学背景不强的合作者共享结果（例如，在云存储上）时。 使用SSP从单端读取自动估计片段长度。 可以在一行中可视化两个样本，描绘了读取富集的共现（例如H3K4me3和H3K27ac