spades:SPAdes基因组组装商

时间:2024-05-26 04:27:41
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文件名称:spades:SPAdes基因组组装商

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更新时间:2024-05-26 04:27:41

C++

SPAdes 3.15.2手册 1.1。 1.2。 1.3。 2.1。 2.2。 2.3。 2.4。 3.1。 3.2。 SPAdes命令行选项3.3。 组装IonTorrent读取3.4。 组装长的Illumina配对读取(2x150和2x250) 3.5。 HMM引导模式3.6。 SPAdes输出3.7。 质粒SPAdes输出3.8。 metaplasmidSPAdes和metaviralSPAdes输出3.9。 生物合成叶片输出3.10。 组装评估 SPAdes软件包中发布的独立二进制文件4.1。 k聚体计数4.2。 k-mer coverage读取过滤器4.3。 k-mer基数估计4.4。 图的构造4.5。 长时间阅读以图对齐4.5.1。 hybridSPAdes对齐器4.5.2。 SPAligner 引文 反馈和错误报告 关于SPAdes SPAdes –圣彼得堡基因组组


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