【文件属性】:
文件名称:过阻尼matlab代码-Cell-aggregation-simulation:用于通过趋化性模拟细胞聚集的测试代码
文件大小:4KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-26 13:41:09
系统开源
过阻尼matlab代码细胞聚集模拟
用于通过趋化性模拟细胞聚集的测试代码。
这是由盘基网柄菌向其自身分泌的细胞外cAMP趋化作用的聚集所激发的。
演示
概述
细胞表示为粒子。
动力包括趋化力和Lennard-Jones势作为体积排阻。
趋化力的方向是cAMP场的梯度。
趋化力的强度是恒定的,f0。
动力学被认为是过阻尼状态,因此惯性项被忽略。
cAMP的外部区域由每个细胞的点源分泌和扩散形成。
在周期性边界条件下执行仿真。
使用四阶Runge-Kutta方法求解等式。
要求
MATLAB(>
=
R2015b)
统计和机器学习工具箱
参数
cellnum:单元格数。
width:模拟字段的边缘长度。
cAMP_secdegdif函数
k1:cAMP生产率。
k2:cAMP降解率。
DcAMP:cAMP的扩散常数。
细胞迁移功能
f0:趋化力的强度。
epsilon,sigma:的拟合参数。
怎么跑
将cAMPsecretion_cellmigration_LJpotential.m文件放在MATLAB目录中。
执行cAMPsecretion_cellmigration_LJpotent
【文件预览】:
Cell-aggregation-simulation-master
----cAMPsecretion_cellmigration_LJpotential.m(7KB)
----README.md(2KB)