文件名称:java红酒网站源码-gatk4:https://github.com/broadinstitute/gatk的猎鹰镜像
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文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-25 02:52:29
系统开源
java网站源码Jenkins 构建状态 AWS HWC 本地 请参阅 ,您可以在其中下载预编译的可执行文件、阅读文档、提出问题并获得技术支持。 GATK 4 该存储库包含下一代基因组分析工具包 (GATK)。 该存储库的内容是 100% 开源的,并在 BSD 3-Clause 许可下发布(请参阅 参考资料)。 GATK4 旨在将来自代码库和代码库的成熟工具整合到一个简化的框架下,并使选定的工具能够在本地集群上或使用 . 它还包含许多新开发的工具,这些工具在早期版本的工具包中不存在。 目录 运行 GATK: Java 8 Python 2.6 或更高版本(需要运行gatk前端脚本) 运行一些工具和工作流需要 Python 3.6.2 以及一组额外的 Python 包。 有关更多信息,请参阅。 R 3.2.5(需要在某些工具中生成图) 构建 GATK: 一个 Java 8 JDK Git 2.5 或更高版本 1.1.0 或更高版本。 需要下载用于构建 GATK 的大文件,以及运行测试套件所需的测试文件。 下载后运行git lfs install ,然后从 git clone 的根目录运行