【文件属性】:
文件名称:java红酒网站源码-gatk4:gatk4
文件大小:36.63MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-06-05 09:05:12
系统开源
java网站源码Jenkins
构建状态
AWS
HWC
本地
请参阅
,您可以在其中下载预编译的可执行文件、阅读文档、提出问题并获得技术支持。
GATK
4
该存储库包含下一代基因组分析工具包
(GATK)。
该存储库的内容是
100%
开源的,并在
BSD
3-Clause
许可下发布(请参阅
参考资料)。
GATK4
旨在将来自代码库和代码库的成熟工具整合到一个简化的框架下,并使选定的工具能够在本地集群上或使用
.
它还包含许多新开发的工具,这些工具在早期版本的工具包中不存在。
目录
运行
GATK:
Java
8
Python
2.6
或更高版本(需要运行gatk前端脚本)
运行一些工具和工作流需要
Python
3.6.2
以及一组额外的
Python
包。
有关更多信息,请参阅。
R
3.2.5(需要在某些工具中生成图)
构建
GATK:
一个
Java
8
JDK
Git
2.5
或更高版本
1.1.0
或更高版本。
需要下载用于构建
GATK
的大文件,以及运行测试套件所需的测试文件。
下载后运行git
lfs
install
,然后从
git
clone
的根目录运行