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今天自己研究出了打包apk的工具，跟大家分享下，现把例子以附件上传，供大家参考，希望能帮上大家的忙。
附件有2个bat批处理文件，我把命令在这里跟大家讲解下，跟大家一起共勉。
CreateDex.bat文件内容：
aapt package -m -J src -M AndroidManifest.xml -S res -I android.jar //这句命令主要是重新自动生成R.java文件,比如增加个图片或者字符串或者增加个layout目录xml文件
mkdir D:\testapk\classes //这句命令是创建个编译*.java源文件输出*.class存放的目录，文件夹名可以随便命名.
javac D:\testapk\src\aimoxiu\theme\moxiutheme\*.java -classpath D:\testapk\android.jar -d D:\testapk\classes\
//这句命令是调用javac工具编译源代码，因此想编译得确保目标计算机已经安装JDK，输出存放的目录是刚才创建的目录
cd D:\testapk\classes
jar cvf aimoxiu.jar *.* //这句命令是把目录下*.class文件打成jar包，为了后面能够创建apk需要的classes.dex文件
cd..
dx --dex --output=classes.dex D:\testapk\classes\aimoxiu.jar //这句命令把刚才的jar包转换成android手机能够运行的dex文件
CreateApk.bat文件内容：
aapt package -z -u -x -f -M AndroidManifest.xml -S res -I android.jar -F moxiu.apk //这句命令生成应用程序apk文件
aapt add moxiu.apk classes.dex //这句命令把前面生成的classes.dex文件压缩到apk文件，最终生成可运行的apk应用程序
java -jar signapk.jar aimoxiu.x509.pem aimoxiu.pk8 moxiu.apk moxiu_theme.apk //这句命令是给生成的apk进行自动签名，无签名的apk是无法安装。因此一个android应用程序apk最终出炉啦！
del moxiu.apk /q //删除刚才生成的无签名的apk文件
Windows操作系统实现不用Eclipse工具实现apk程序编译及打包使用该工具，本人已经测试通过，生成的apk文件也能在android真机上运行,工具见附件