常规转录组测序
样品类型:去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA
样品需求量(单次):
植物和真菌样品:≥20 μg;
人、大鼠、小鼠样品:≥5 μg;
其他类型动物:≥10 μg;
原核生物样品:≥5μg。
样品浓度:
植物和真菌样品:≥250 ng/μL;
人、大鼠、小鼠样品:≥65 ng/μL;
其它类型动物样品:≥150 ng/μL;
原核生物样品:≥65 ng/μL。
样品纯度:
真核:OD260/280 =1.8~2.2;OD260/230 ≥2.0;
动物样品:RIN ≥ 7.0,
植物样品:RIN ≥6.5,28S:18S ≥1.0;
昆虫样本无此指标;
原核生物样品:OD260/280≥1.8;
OD260/230 ≥1.8;
RIN ≥6.0,23S:16S≥1.0。
可以分别采用Nanodrop、Qubit 2.0、Aglient 2100方法检测RNA样品的纯度、浓度和完整性等,以保证使用合格的样品进行转录组测序。