黑色是我码的，其余均为ChatGPT/New bing生成
一、写在前面
嘿！科研狗们，相信大家在读SCI文献的时候，都曾遇到过抓狂的时刻吧？毕竟那些专业术语和技术性词汇，真的是让人头疼啊。但是，现在有了ChatGPT技术，我们就不用再愁啦！它可以帮我们快速阅读和总结文献的主要内容，不仅提高了效率，也让我们少了很多烦恼。
ChatGPT是一款基于GPT-3.5架构的自然语言处理模型，有自动理解、自动回复和自动总结等多种神奇功能。只需要上传文献全文，ChatGPT就会自动分析文献的核心内容，并生成简明扼要的总结。同时，ChatGPT还能进行翻译和问答等操作，真是太方便啦！
目前能用的工具有挺多，我都试用了，现给大家推荐2款：New bing和SCISPACE。
二、New bing
（1）New bing简介
可能很多小伙伴不懂New bing是啥，让TA自我介绍吧：
New Bing是一个全新的AI驱动的搜索引擎，它可以帮助你更快更容易地在网上找到你需要的东西。它可以回答复杂的问题，提供完整的答案，与你互动地聊天，还可以为你生成内容。它就像是你在网上的AI副驾驶。
New Bing还与新的Edge浏览器无缝协作，Edge浏览器也有新的AI能力，新的外观和两个新的功能：聊天和创作。你可以使用聊天功能从任何网页上请求摘要、要点、翻译等。你还可以使用创作功能在AI的帮助下创建内容，比如博客文章、推文、论文等。
New Bing对于文献阅读特别有用，因为它可以帮助你快速了解任何论文的背景、方法和结果。你还可以让New Bing帮你润色你的论文，为你审稿或者帮你回复审稿人的意见。
（2）New bing使用方式
让TA自己说：
一种是直接在浏览器中打开/new，这是New Bing的预览版网站，你可以在这里输入你的问题或者需求，然后看到New Bing给你的回复。你也可以点击聊天按钮，和New Bing进行更多的交互。
另一种是在新版的Edge浏览器中使用New Bing，Edge浏览器也有新的AI能力，新的外观和两个新的功能：聊天和创作。你可以在任何网页上打开Edge侧边栏，然后使用聊天功能从New Bing那里获取摘要、要点、翻译等。你也可以使用创作功能在AI的帮助下创建内容，比如博客文章、推文、论文等。
我来说两句：New bing使用门槛其实比小Chat要高，不少人的侧边框都打不开（也就是第二种），只能使用第一种网页版本。具体原因众说纷纭，大家就八仙过海各显神通吧。微软为了封堵我们，真是煞费苦心呐。
三、SCISPACE使用方式
SCISPACE是一个专为科学家和研究人员打造的在线写作平台，可以帮助你快速、高效、优雅地完成你的论文。
使用方式简单粗暴，登录并注册SCISPACE（网址：/），点击右上角的My Library，上传的文献全文，单击上传的文献，就可以在右侧的对话框针对文章内容进行交互，还可以选择你想要使用的语言。
四、New bing和SCISPACE测评
下面我使用一篇SCI文献对New bing和SCISPACE进行测评，这是一篇刚发表的文章：
标题：Aspergillus fumigatus hijacks human p11 to redirect fungal-containing phagosomes to non-degradative pathway；
发表在：2023 年 3 月的 Cell Host & Microbe 杂志上；
论文地址：/publication/369100630；
主要内容：关于人类病原真菌 Aspergillus fumigatus 如何通过劫持人类 p11 蛋白来重定向真菌包含的吞噬体到非降解途径。文章发现 p11 蛋白是调节吞噬体成熟的关键节点，被 Aspergillus fumigatus 针对性攻击。在 p11 基因中的一个单核苷酸多态性与侵袭性曲霉病的易感性相关。
我将通过五个问题测评2个应用的性能：
1.这篇文章的主要内容是什么？
2.文章是怎么层层论证这个假设的？
3.介绍图1的实验方法、主要结果和结论。
4.在研究HscA蛋白的时候，为什么要用Hsp70蛋白作对照？
5.本研究有什么局限性？
下面是具体测评结果：
1、这篇文章的主要内容是什么？
Bing：这篇文章的主要内容是关于一项研究，该研究发现人类病原真菌Aspergillus fumigatus通过劫持人类p11蛋白来重定向真菌包含的吞噬体到非降解途径。文章中提到，人类p11蛋白是吞噬体成熟的调控节点，Aspergillus fumigatus的HscA蛋白将p11锚定在吞噬体膜上，p11将吞噬体重定向到非降解途径，从而允许分生孢子逃逸。此外，p11基因中的一个单核苷酸多态性与侵袭性曲霉菌病的易感性相关。这些发现揭示了p11在介导真菌吞噬体逃避中的作用。
SCISPACE：这篇文章的重点是提供有关一篇研究论文的信息，该论文研究了真菌 Aspergillus fumigatus 如何避免被人体细胞杀死。该论文确定了一种名为p11的蛋白质，它是烟曲霉靶向的吞噬体成熟的关键调节剂，以及p11基因中一种与侵袭性曲霉病易感性相关的单核苷酸多态性。该帖子还提供了有关研究中使用的方法的技术细节，例如菌株构建和聚合酶链反应分析。
解读：第一题考察的是全文总结能力，2个应用均能概括出全文内容，但是New bing显然略胜一筹，TA概括得更加具体。
2、文章是怎么层层论证这个假设的？
Bing：文章中的作者通过一系列实验来支持他们的假设。他们首先通过生物素化和亲和纯化来鉴定真菌表面蛋白HscA能够与宿主上皮细胞结合。然后，他们通过生成hscA缺失突变体来探究HscA在病原体-宿主相互作用中的作用。结果发现，与野生型菌株相比，hscA缺失突变体对宿主细胞造成的损伤较小，与宿主细胞的结合也减少了。此外，hscA缺失突变体内的分生孢子更容易进入酸化的吞噬体。
接下来，作者通过亲和纯化和LC-MS/MS分析来鉴定HscA的结合伙伴。结果发现，人类p11蛋白是HscA的一个靶标。为了进一步研究p11在HscA介导的粘附和吞噬中的作用，作者检查了这些蛋白在A549细胞感染分生孢子后的亚细胞定位。结果发现，p11和AnxA2都存在于吞噬杯和包含分生孢子的吞噬体上。
最后，作者发现，在接触Aspergillus fumigatus分生孢子后，p11的数量增加了。总之，这些数据表明，HscA介导了分生孢子与宿主细胞的粘附，并阻止了包含分生孢子的吞噬体的成熟
SCISPACE：文章使用各种实验方法研究了假设，即 A. fumigatus 可以通过靶向 p11 蛋白来逃避宿主免疫系统。这些方法包括：
1.菌株构建：作者使用分裂标记聚合酶链反应策略将 A. fumigatus 菌株 CEA17 dakub KU80 中的 hygromycin B 磷酸转移酶基因替换为 hygromycin B 磷酸转移酶基因。
南方和北方印迹分析：作者使用这些技术来证实 hscA 基因的缺失以及 hph 和 gfp 基因在构造菌株中的表达。
2.显微镜：作者使用共聚焦显微镜来可视化含有 A. fumigatus conidia 的吞噬体在人体细胞中的定位，并评估 p11 敲除对吞噬体成熟的影响。
3.单核苷酸多态性分析：作者进行了一项全基因组关联研究，以确定与侵袭性曲霉病易感性相关的单核苷酸多态性，并发现p11基因中的单核苷酸多态性与疾病易感性显著相关。
总体而言，这篇文章提供了分子、细胞和遗传层面的证据，以支持A. fumigatus靶向p11蛋白以逃避宿主免疫系统的假设。
解读：第二题考察的是全文逻辑的把控能力，2个应用的表现差距明显，New bing概括的层次分明、详略得当，但是每一部分缺少了一句话来概括，可惜；SCISPACE的表现，辣眼睛哦。
3、介绍图1的实验方法、主要结果和结论。
Bing：图1描述了作者用来鉴定真菌表面蛋白HscA能够与宿主上皮细胞结合的实验方法和结果。作者首先通过生物素化和亲和纯化来鉴定真菌表面蛋白HscA能够与宿主上皮细胞结合。他们使用生物素化技术来标记A. fumigatus表面蛋白，然后将这些蛋白提取出来并加入到A549细胞中。通过免疫荧光成像，他们发现，来自萌发丝，但不是休眠分生孢子或菌丝体的蛋白提取物能够标记A549细胞的表面。
接下来，作者通过western blot分析来鉴定与宿主细胞结合的候选蛋白。他们发现，在萌发丝和（信号较弱）肿胀分生孢子的蛋白提取物中，有一种分子量为70 kDa的候选蛋白。在检测到的分子量约为70 kDa的六种蛋白中，只有热休克蛋白HscA主要在萌发丝样品中被鉴定出来。实际上，hscA基因的mRNA水平在肿胀分生孢子中上调，与之相应的是HscA蛋白水平在肿胀分生孢子和萌发丝中也增加了。
此外，作者还通过免疫荧光成像技术证实了HscA-Myc在萌发丝表面的存在。为了进一步证实这一点，他们将N端Twin-Strep-tag修饰的重组HscA (rHscA) 和Hsp70 (rHsp70) 与A549细胞共孵育，结果发现rHscA而非rHsp70能够与A549细胞结合。
总之，图1展示了作者通过一系列实验鉴定出真菌表面蛋白HscA能够与宿主上皮细胞结合，并证实了这一结果。
SCISPACE：论文的图 1 显示了 A. fumigatus 菌株的南方和北方印迹分析结果。此图中使用的实验方法包括：
1.菌株构建：作者使用分裂标记聚合酶链反应策略将 A. fumigatus 菌株 CEA17 dakub KU80 中的 hygromycin B 磷酸转移酶基因替换为 hygromycin B 磷酸转移酶基因。
blot 分析：作者使用这种技术证实了构建菌株中hscA基因的缺失。
blot分析：作者使用这种技术来评估已建菌株中hph和gfp基因的表达。
图 1 的主要结果是：
blot分析证实，在构建的菌株中成功删除了hscA基因。
和 gfp 基因在构建的菌株中表达，Northern blot 分析证实。
从图 1 中可以得出的结论是：
1.构建的菌株可用于研究 hscA 基因在 A. fumigatus 发病机制中的作用。
2.在未来的实验中，hph 和 gfp 基因可以分别用作可选标记物和报告者。
解读：第三题考察的是某一个具体结果的解读概括能力，2个应用的表现同样差距明显，New bing更胜一筹。
4、在研究HscA蛋白的时候，为什么要用Hsp70蛋白作对照？
Bing：在研究HscA蛋白时，作者使用Hsp70蛋白作为对照，是为了排除其他因素对实验结果的影响。HscA和Hsp70都属于热休克蛋白家族，具有相似的分子量和结构。因此，使用Hsp70作为对照可以排除实验结果是由于热休克蛋白家族成员的一般特性所致。例如，在测试HscA与宿主细胞的结合能力时，作者将重组HscA (rHscA) 和重组Hsp70 (rHsp70) 与宿主细胞共孵育。结果发现，rHscA而非rHsp70能够与宿主细胞结合，这表明HscA与宿主细胞的结合是特异性的，而不是由于热休克蛋白家族成员的一般特性所致。
SCISPACE：在研究 HSCA 蛋白时，应将 Hsp70 蛋白用作对照，因为它是一种特征良好的伴侣蛋白，已知会与 HSCA 相互作用。使用Hsp70作为对照可以帮助确认HSCA与其他蛋白质（例如p11）之间相互作用的特异性。本文在鉴定HSCA相互作用蛋白的共免疫沉淀实验的背景下讨论了这一点。
解读：第四题考察的是具体实验细节的解读能力，2个应用的表现均令人满意，但是New bing的解读更详细且通俗易懂，TA甚至还举了例子。
5、本研究有什么局限性？
Bing：这篇文章并未明确提及其研究的局限性。然而，像所有科学研究一样，这项研究也可能存在一些局限性。例如，本研究主要使用体外细胞培养模型来研究Aspergillus fumigatus与宿主细胞的相互作用。尽管这些模型能够提供有价值的信息，但它们并不能完全模拟真实的生理条件。因此，进一步的体内研究是必要的，以验证这些发现在生物体内是否仍然成立。
此外，本研究主要关注了HscA蛋白与p11蛋白之间的相互作用。然而，Aspergillus fumigatus可能通过多种机制来逃避宿主免疫系统，而p11蛋白也可能与其他宿主蛋白发生相互作用。因此，进一步的研究是必要的，以更全面地了解Aspergillus fumigatus与宿主细胞之间复杂的相互作用。
SCISPACE：这项研究的局限性包括：
1.该研究是在体外和细胞培养模型中进行的，可能无法完全反映体内发生的宿主与病原体相互作用的复杂性。
2.该研究的重点是HSCA蛋白在烟曲霉发病机制中的作用，但其他因素也可能有助于该真菌逃避宿主免疫系统的能力。
3.该研究使用了单一的 A. fumigatus 菌株和有限数量的人类细胞系，它们可能无法代表临床环境中遇到的所有烟曲霉菌株和宿主细胞类型。
4.该研究没有调查其他宿主因子，例如细胞因子和趋化因子，在烟曲霉感染免疫反应中的潜在作用。
5.该研究没有调查温度和养分可用性等环境因素在烟曲霉发病机制中的潜在作用。
解读：第五题考察的是总结和扩展能力，2个应用的表现均一般，没有惊艳我。看来仅仅只是归纳概括文章，还没能达到外扩和联想的层次。
五、写在最后
测试了一下，New bing的网页版没有边框版的文献解读功能（尝试了各种问法都不行）。所以，SCISPACE其实也够用了吧。
