R语言连接数据库
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数据是关系数据库系统中存储的统一化格式。 因此,实施我们需要非常先进和复杂的SQL查询统计计算。但是R能够轻松地连接到诸如MySql, Oracle, Sql server等多种关系数据库并且可以从它们的记录转为R中的数据帧。一旦数据是在R环境中可用,就变成了正常R数据集,并可以被操纵或使用所有强大包和函数来进行分析。
在本教程中,我们将使用 MySQL 作为参考数据库,用于连接到 R 中。
RMySQL 软件包
R有一个名为“RMySQL”它提供了与 MySQL 数据库之间的本地连接的内置软件包。可以使用下面的命令来安装这个包到 R 的环境。
install.packages("RMySQL")
连接R到MySql
一旦软件包安装,我们创建 R 的连接对象连接到数据库。这需要用户名,密码,数据库名和主机名作为输入。
# Create a connection Object to MySQL database. # We will connect to the sampel database named "sakila" that comes with MySql installation. mysqlconnection = dbConnect(MySQL(), user='root', password='', dbname='sakila', host='localhost') # List the tables available in this database. dbListTables(mysqlconnection)
当我们上面的代码执行时,它产生以下结果:
[1] "actor" "actor_info" [3] "address" "category" [5] "city" "country" [7] "customer" "customer_list" [9] "film" "film_actor" [11] "film_category" "film_list" [13] "film_text" "inventory" [15] "language" "nicer_but_slower_film_list" [17] "payment" "rental" [19] "sales_by_film_category" "sales_by_store" [21] "staff" "staff_list" [23] "store"
查询表
我们可以使用函数 dbSendQuery()查询在MySQL数据库表。查询获取执行在MySQL中并使用fetch()函数返回结果集。最后,它被存储为R的数据帧。
# Query the "actor" tables to get all the rows. result = dbSendQuery(mysqlconnection, "select * from actor") # Store the result in a R data frame object. n=5 is used to fetch first 5 rows. data.frame = fetch(result, n=5) print(data.fame)
当我们上面的代码执行时,它产生以下结果:
actor_id first_name last_name last_update 1 1 PENELOPE GUINESS 2006-02-15 04:34:33 2 2 NICK WAHLBERG 2006-02-15 04:34:33 3 3 ED CHASE 2006-02-15 04:34:33 4 4 JENNIFER DAVIS 2006-02-15 04:34:33 5 5 JOHNNY LOLLOBRIGIDA 2006-02-15 04:34:33
查询与筛选子句
我们可以通过任何有效的 select 查询得到结果。
result = dbSendQuery(mysqlconnection, "select * from actor where last_name='TORN'") # Fetch all the records(with n = -1) and store it as a data frame. data.frame = fetch(result, n=-1) print(data)
当我们上面的代码执行时,它产生以下结果:
actor_id first_name last_name last_update 1 18 DAN TORN 2006-02-15 04:34:33 2 94 KENNETH TORN 2006-02-15 04:34:33 3 102 WALTER TORN 2006-02-15 04:34:33
更新表的行
我们可以通过传递更新查询到dbSendQuery()函数更新一个MySQL表中的行。
dbSendQuery(mysqlconnection, "update mtcars set disp = 168.5 where hp = 110")
在执行上面的代码后,我们可以看到该表在MySQL环境中已经更新。
将数据插入到表
dbSendQuery(mysqlconnection, "insert into mtcars(row_names, mpg, cyl, disp, hp, drat, wt, qsec, vs, am, gear, carb) values('New Mazda RX4 Wag', 21, 6, 168.5, 110, 3.9, 2.875, 17.02, 0, 1, 4, 4)" )
执行上面的代码后,我们可以看到插入到表在MySQL环境的记录行。
在MySQL中创建表
我们可以使用函数dbWriteTable()创建一个表在MySQL中。它覆盖表,如果它已经存在,并且需要一个数据帧输入。
# Create the connection object to the database where we want to create the table. mysqlconnection = dbConnect(MySQL(), user='root', password='', dbname='sakila', host='localhost') # Use the R data frame "mtcars" to create the table in MySql. # All the rows of mtcars are taken inot MySql. dbWriteTable(mysqlconnection, "mtcars", mtcars[, ], overwrite = TRUE)
在执行上面的代码后,我们可以看到在MySQL环境中有创建后的表。
在MySQL删除表。
我们可以把 MySql 数据库这个表删除,通过 DROP TABLE 语句发送到 dbSendQuery(),与之前从表查询数据的方式相同。
dbSendQuery(mysqlconnection, 'drop table if exists mtcars')
在执行上面的代码后,我们可以看到该表在MySQL环境被丢弃。