R语言-连接MySQL数据库方法

1、使用R数据库接口

连接MySQL，使用RMySQL包，使用前RMySQL包要先安装。

library(RMySQL)

连接方式有2种：

（1）使用dbConnect
conn <- dbConnect(MySQL(), dbname = "rmysql", username="rmysql", password="rmysql", host="127.0.0.1", port=3306)

数据操作方法：

dbWriteTable(conn, "tablename", data) #写表
dbReadTable(conn, "tablename")  #读表
dbDisconnect(conn) #关闭连接

（2）使用sqldf包

首先要安装sqldf包，其次调用：

>library(sqldf)

> sqldf("select * from t_data",dbname="test",drv="MySQL",user="root",password="",host="127.0.0.1",port=3306)

连接后，SQL查询语句后面的参数均可省略，例如：

> sqldf("select * from t_data limit 0,10")

2、使用ODBC连接

在Windows下配置ODBC（开放数据库连接），具体步骤如下：
（1）R下载RODBC包，安装好。
（2）在http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc下载mySQL ODBC，安装好。
（3）Windows：控制面板->管理工具->数据源（ODBC）->双击->添加->选中mysqlODBC driver一项
填写：data source name 一项填入你要使用的名字，自己随便命名，例如：mysql_data;
description一项随意填写，例如mydata
TCP/IP Server 填写本机服务器IP，一般为：127.0.0.1
user 填写你的mysql用户名
password 填写你的mysql密码
然后数据库里会出现你的mysql里的所有数据库，选择一个数据库。
确定。
（4）打开R的界面调用数据库：

library(RODBC); 

channel <- odbcConnect("mysql_data", uid="root", pwd="123"); 

sqlTables(channel);#查看数据中的表 

data<-sqlFetch(channel,"kegg")# 查看表的内容，存到数据框里 

参考文章：

1、R语言连接Mysql数据库的步骤及简单使用mysql数据库中的数据（学习笔记）.http://www.dataguru.cn/thread-289411-1-1.html

2、R语言连接mySQL数据库步骤. http://blog.sina.com.cn/s/blog_ab3fbf1b0101komj.html

3、R连接MySQL数据库方法备忘. http://www.r-bloggers.com/lang/chinese/1247

以下的实验环境是在windows7-32操作系统下进行
1、下载（mySQL-connector-odbc-5.3.2-win32.msi）
     下载地址：http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc
      如果下载不了的同学可以下直使用我的附件
     mysql-connector-odbc-5.3.2-win32.rar (6.64 MB) 
2、安装Mysql的RODBC：mysql-connector-odbc-5.3.2-win32.msi
3、配置datasource
 
 

以上Datasource配置成功 4、R软件访问mysql数据库 （1）安装及加载RODBC

1. install.packages("RODBC")
   
2. library(RODBC)

复制代码 （2）与mysql建立连接

1. channel=odbcConnect("mysqlodbc", uid="root", pwd="123456")

复制代码 （3）查询该数据库下都有哪些数据库表

1. > sqlTables(channel)
   
2.   TABLE_CAT TABLE_SCHEM   TABLE_NAME TABLE_TYPE REMARKS
   
3. 1      test                       aa      TABLE        
   
4. 2      test              first_table      TABLE        
   
5. 3      test             second_table      TABLE        
   
6. 4      test                 students      TABLE   

复制代码 （4）查询某个表中的数据返回给数据框

1. > students=sqlFetch(channel,"students")
   
2. > students
   
3.     id     name age address        tel score
   
4. 1  101 潘国远01  90    北京 2147483647  99.9
   
5. 2  102 潘国远02  90    北京 2147483647  99.9
   
6. 3  103 潘国远03  90    北京 2147483647  99.9
   
7. 4  104 潘国远04  90    北京 2147483647  99.9
   
8. 5  105 潘国远05  90    北京 2147483647  99.9
   
9. 6  106 潘国远06  90    北京 2147483647  99.9
   
10. 7  107 潘国远07  90    北京 2147483647  99.9
    
11. 8  108 潘国远08  90    北京 2147483647  99.9
    
12. 9  109 潘国远09  90    北京 2147483647  99.9
    
13. 10 110 潘国远10  90    北京 2147483647  99.9

复制代码 （5）条件查询

1. > sqlQuery(channel,"select name,age,address,score from students where id < 105 order by id desc")
   
2.       name age address score
   
3. 1 潘国远04  90    北京  99.9
   
4. 2 潘国远03  90    北京  99.9
   
5. 3 潘国远02  90    北京  99.9
   
6. 4 潘国远01  90    北京  99.9

复制代码 （6）将数据框中的数据保存到数据库表中
 
数据框的首列没有列名，所以在保存之前需要指定列名

1. sqlSave(channel, USArrests, rownames = "state", addPK = TRUE)

复制代码  

从以上可以看出，数据框能正确的保存到mysql数据库中去了
（7）在R软件将刚才添加到mysql数据库中的表删除掉

1. sqlDrop(channel,"usarrests")

复制代码 （8）关闭连接资源

1. odbcClose(channel)

复制代码