文件名称:TCGA-Assembler-2:TCGA组装器2
文件大小:37.65MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-04 05:05:13
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TCGA组装器2 TCGA-Assembler 2是可免费下载的开源工具,可自动下载,组装和处理TCGA样本的癌症基因组图谱(TCGA)数据和临床蛋白质组学肿瘤分析协会(CPTAC)数据。 通过减轻调查人员的数据准备负担,它可以促进下游数据分析。 TCGA-Assembler 2包含两个模块。 模块A从美国国家癌症研究所的基因组数据共享区(GDC)获取公共TCGA数据,并将单个数据文件组装到本地存储的数据表中。 它还可以获取由CPTAC生成的TCGA样品的质谱蛋白质组学数据。 模块B满足各种数据处理需求,以准备进行下游分析。 TCGA-Assembler 2在GPL版本3下获得许可,并且可以在GPL版本3下分发。 网址: : 当前版本:2.0.6
【文件预览】:
TCGA-Assembler-2-master
----README.md(936B)
----TCGA-Assembler()
--------Manual.pdf(525KB)
--------ManualExampleData()
--------Module_B.R(58KB)
--------QuickStartExample.R(8KB)
--------Tutorial.pdf(2.28MB)
--------curl.exe(1.11MB)
--------Module_A.R(156KB)
--------SupportingFiles()
----LICENSE(34KB)