文件名称：germVar2:TCGA种系变体
文件大小：3.61MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-04 03:38:32
Python
胚芽2 补充材料 泛癌测序分析显示癌症基因中频繁发生种系突变 姜若木，威廉·李，纳德姆·里亚兹，克里斯·桑德，蒂莫西·米奇森^ ，黛博拉·S·马克斯^ 安装 install.packages("devtools") library(devtools) install_github("rj67/germVar2") 数据对象 可以加载的数据框 list_goi-候选基因列表 基因 批准名称 合奏基因 千年发展目标 CPG 班级 83 自动取款机 ATM丝氨酸/苏氨酸激酶 ENSG00000149311 真的 真的 时差 135 BRCA1 乳腺癌1，早发 ENSG00000012048 真的 真的 时差 all_patients-所有患者信息 病人 疾病2 年龄 Agez EA 种族2 性别 P6-A5OG 行政协调会 45 -0.2248333 真的 白色的
【文件预览】：
germVar2-master
----NAMESPACE(25B)
----DESCRIPTION(286B)
----R()
--------variant_handle_misc.R(0B)
--------plot_style_misc.R(6KB)
--------data_description.R(2KB)
--------plotMutRNASeq.R(1KB)
--------plotDiseaseDistr.R(2KB)
----README.md(4KB)
----data()
--------nsSNP_vars.rda(99KB)
--------LoF_vars.rda(201KB)
--------all_patients.rda(284KB)
--------LoF_muts.rda(292KB)
--------nsSNP_muts.rda(342KB)
--------list_goi.rda(64KB)
----man()
--------nudgeXY.Rd(449B)
--------unifyPlotDim.Rd(405B)
--------plotMutRNASeq.Rd(565B)
--------plotDiseaseDistr.Rd(395B)
--------LoF_muts.Rd(471B)
--------sigSymbol.Rd(315B)
--------nsSNP_muts.Rd(477B)
--------labelDisease.Rd(358B)
--------expand_outer.Rd(471B)
--------LoF_vars.Rd(682B)
--------list_goi.Rd(430B)
--------all_patients.Rd(698B)
--------nsSNP_vars.Rd(688B)
--------replaZero.Rd(289B)
--------extractPatient.Rd(326B)
----exec()
--------jupyter_notebooks()
--------variant_manipulation()
--------variant_calling()
----.gitignore(29B)