【文件属性】：
文件名称：web-TCGA:用于访问 TCGA 数据的轻量级闪亮 Web 应用程序
文件大小：31KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-06-09 12:24:36
R
安装
结构
数据
在这里你有你的原始数据，通过 firehose_get 脚本从 firehose 下载。 在这里您需要一些存储空间，具体取决于您的实体
预处理数据
以下是将原始数据转换为 TCGA-Webtools 数据（更广为人知的 .RData）所需的脚本
网络应用程序
这是最终的应用程序，也是最终的数据对象，需要一些空间
安装
首先你需要 firehose_get 脚本，从 firehose 下载数据，你可以使用
cd /path/to/TCGA-Webtools wget 解压 firehose_get_latest.zip
之后，您可以下载您感兴趣的实体。 这可能需要一些时间，即小时的含义。 以下行将下载所有 TCGA-Webtools 支持的数据，用于前列腺腺癌 (PRAD) 和乳腺癌浸润性癌 (BRCA)。 更多实体请查看： :
cd Data ../firehose_
【文件预览】：
web-TCGA-master
----shinytcga.Rproj(205B)
----webapp()
--------Functions()
--------global.R(966B)
--------ui.R(8KB)
--------tcga.barcode.lib()
--------server.R(15KB)
----Entities.txt(84B)
----firehose_get(18KB)
----.gitignore(37B)
----Tests()
--------Exp-Data_and_Plots.R(393B)
----pre-process_data()
--------Methlyation()
--------Variants()
--------.Rhistory(388B)
--------CopyNumber()
--------init.R(405B)
--------Expression()
--------MarkdownStats()
----README.md(1KB)