文件名称:如何把matlab代码封装-pysurfing:使用Python使用Freesurfer进行可视化
文件大小:438KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-12 20:11:18
系统开源
如何把matlab代码封装 PySurfing 使用来自Python的Freesurfer进行可视化 Freesurfer是一个功能强大的工具,并提供大量功能来处理和分析MRI图像。 Freesurfer还使用从用户定义的(手动)标签或其标签之一派生的小片段来生成灰色(和白色)物质分割。 Freesurfer还附带了一个名为tksurfer的方便工具,该工具可以根据地图集标签上色,例如,对表面进行着色。 PySurfing是一种开源工具,扩展了tksurfer,提供了一个接口,可轻松为Freesurfer地图集的区域着色,该区域已对其进行了(全部)分割。 PySurfing受到Anderson Winkler博士的工作的鼓舞,他对创建一种可访问的方法进行网络神经变性模拟的解剖可视化感兴趣。 PySurfing由,和进行概念化和编写。 PySurfing的愿景是提供一种工具,以方便地可视化在解剖学表面上进行数学建模得到的结果。 软件需求 主要软件包 PySurfing需要安装以下软件 Freesurfer版本7或更高版本() Matlab版本2020b Python 3.8或更高版本 P
【文件预览】:
pysurfing-main
----simulation-activation-map-demo.py(9KB)
----Readme.md(26KB)
----blogit.md(5KB)
----__init.py__(1B)
----replace_ctab.m(2KB)
----img()
--------simulationactivation.jpg(206KB)
--------.gitkeep(1B)
--------lobeactivation.jpg(26KB)
--------braakactivation.jpg(130KB)
----LICENSE(34KB)
----activationmaps()
--------parcellations.py(12KB)
--------exporting.py(7KB)
--------coloring.py(4KB)
--------activations.py(10KB)
--------.gitkeep(1B)
----pysurfer.jpg(53KB)
----series-activation-map-demo.py(9KB)
----lobe-activation-map-demo.py(5KB)