Pisces:扩增子数据的体细胞和种系变异调用程序。 仅肿瘤工作流程的推荐调用者

时间:2024-06-20 08:29:37
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文件名称:Pisces:扩增子数据的体细胞和种系变异调用程序。 仅肿瘤工作流程的推荐调用者

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更新时间:2024-06-20 08:29:37

C#

双鱼座 此应用程序在 linux 或 windows 上调用低频变体。 它将在仅肿瘤样本上运行,并搜索 SNV、MNV 和小插入缺失。 它接受 .bams 并生成 .vcf 或 .gvcf 文件。 它包含在 Illumina MiSeqReporter 管道和各种 BaseSpace 工作流程中。 调用者也可以作为独立程序运行。 POC: 和 快速入门: 执照 Pisces 源代码是在 GPLv3 许可下提供的。 Pisces 包括在其他开源许可证下提供的第三方软件包,请参阅 COPYRIGHT.txt 了解更多详细信息。 系统要求 64 位操作系统。 如果在 Linux 上运行,则需要 Pisces 解决方案中包含的“libFileCompression.so”文件。 如果您使用预编译的 Pisces 二进制文件,它应该已经在应用程序旁边。 对于Pisces 5.2.5及更高版本


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