PCR-DGGE分析湿地植物根际土壤细菌群落实验条件优化 (2010年)

时间:2024-06-06 00:43:51
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更新时间:2024-06-06 00:43:51

自然科学 论文

为了更好地利用PCR-DGGE技术分析湿地植物根际土壤样品的细菌多样性,选取3对通用引物,优化了PCR扩增16S rDNA的实验条件,并优化了DGGE的变性剂浓度梯度范围和电泳时间长度。结果显示:PCR时采用退火温度touch-down程序,能够提高扩增特异性。引物357f/518r和357f/907 rM扩增靶序列的DGGE变性剂浓度梯度理想范围分别为50%-80%和40%-70%,最佳电泳时间长度分别为17h和 14 h.比较DGGE分析图谱的条带数以及Shannon多样性指数,357f/518r呈现


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