文件名称:基于残基涨落的加权氨基酸网络的构建及应用 (2010年)
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更新时间:2024-06-03 05:36:38
工程技术 论文
提出了一种以残基间距离涨落为权重的氨基酸网络的加权方式。对180个蛋白质的加权与非加权氨基酸网络的拓扑特征量进行了分析。统计结果表明,氨基酸网络具有明显的小世界特征,加权网的平均集聚系数比非加权网的小。节点度分布具有幂律形式,显示了网络的层次模块性,进一步发现疏水残基对这一性质起了主要作用。另外,加权网的介数对折叠核的区分能力强于非加权网,表明加权网较非加权网包含了更多的蛋白质结构信息。