文件名称：工程项目
文件大小：29.32MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-14 00:33:36
JupyterNotebook
突变分类 该存储库包含脚本，这些脚本用于生成样本并执行统计方法中报告的分析，该方法使用Zhu，Ong和Huttley的机器学习技术对ENU诱导的小鼠自发性种系突变进行突变分类。 最初设定 ENU_project.yml文件有助于建立一个名为mclass的虚拟环境，并在该虚拟环境中安装所有必需的依赖项。 运行以下命令以使用mclass创建mclass环境（请确保已安装最新版本的conda）。 $ conda env create -f ENU_project.yml 通过运行以下命令激活mclass环境： $ source activate mclass 该环境已安装了所有必需的依赖项，以运行此存储库中的所有脚本。 回购内容 该存储库包含用于运行两个完全独立的分析的脚本。 loglin目录包含用于运行对数线性分析的脚本和数据。 对数线性分析比较了ENU诱导的小鼠突变和自发突变在小鼠