NovelSeq:新型序列插入检测-开源

时间:2024-05-18 16:40:35
【文件属性】:

文件名称:NovelSeq:新型序列插入检测-开源

文件大小:68KB

文件格式:GZ

更新时间:2024-05-18 16:40:35

开源软件

NovelSeq管线设计为使用高通量配对末端全基因组测序数据检测新序列插入。


【文件预览】:
novelseq-upload
----type1to2convertor(15KB)
----OEASetsProb.cpp(7KB)
----greedyMatching.out(14KB)
----type1to2convertor.cpp(3KB)
----unique.cpp(333B)
----novel_cluster.cpp(3KB)
----fs-fa(17KB)
----calProbMinEditRead(10KB)
----parserQualWReadPrunWSatellite(11KB)
----oea.LocalAssembly.cpp(16KB)
----a.out(11KB)
----histogram(5KB)
----createScoreMatrix.cpp(20KB)
----convertToInvLRProbMinEditDist.cpp(3KB)
----chros()
--------chroName19(15B)
--------chroName24(15B)
--------chroName1(15B)
--------chroName22(15B)
--------chroName15(16B)
--------chroNameX(15B)
--------chroName21(15B)
--------chroName6(15B)
--------chroName12(16B)
--------chroName10(16B)
--------chroName13(16B)
--------chroNameY(14B)
--------chroName3(15B)
--------chroName18(15B)
--------chroName7(15B)
--------chroName16(15B)
--------chroName14(16B)
--------chroName5(15B)
--------chroName4(15B)
--------chroName8(15B)
--------chroName20(15B)
--------chroName11(16B)
--------chroName2(15B)
--------chroName23(15B)
--------chroName9(15B)
--------chroName17(15B)
----setCoverProbWeighted.cpp(12KB)
----novel_cluster(9KB)
----greedyMatching.cpp(10KB)
----setCoverProbWeighted(11KB)
----unique(8KB)
----sortString(8KB)
----oea.LocalAssembly.out(19KB)
----fs-fa.c(15KB)
----OEASetsProb(11KB)
----VariationHunter_SC.cpp(2KB)
----parserQualWReadPrunWSatellite.cpp(9KB)
----convertToInvLRProbMinEditDist(10KB)
----calProbMinEditRead.cpp(3KB)
----sortString.c(1KB)

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