文件名称：FiberNetwork:使用 Fiber RNA seq 数据进行 WGCNA 分析
文件大小：4.64MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-24 16:30:54
R
光纤网络 使用 Fiber RNA seq 数据进行 WGCNA 分析。 #目的 这组脚本接收 RNA seq 表达数据并从数据构建共表达网络。 使用这些脚本时，您需要修改几行才能使您的自定义代码起作用。 因此，这更多的是用于生成与该项目相关联的数据的过程和代码的记录，这些脚本集旨在作为您自己分析的起点，而不是分发就绪的脚本集。 每个脚本的简要细节可以在文件描述中提供，但值得一提的是这些操作的逻辑顺序： #包括脚本和简要说明。 [1] Fiber_Norm_RPM.R 将接收原始计数数据并输出标准化库以及库大小。 [2] WGCNA_construct.R 将修剪基因集。 生成 co-expression 对象并放入一个目录中（您可以通过修改脚本来指定它。） [3] WGCNA_analysis.R 将执行一些更高级别的分析，以可视化共表达网络之间的异同。 [4]constr
【文件预览】：
FiberNetwork-master
----HomeoTtest.R(5KB)
----HomeoAnalysis.Rmd(10KB)
----.Rhistory(0B)
----HomeoSwitch.R(4KB)
----WGCNA_analysis.R(10KB)
----Fiber_Norm_RPM.R(1KB)
----LICENSE(18KB)
----HomeoNetwork.R(18KB)
----edgeTest.pl(2KB)
----HomeoBiasBarPlot.pdf(5KB)
----eigenGene_expression.pdf(26KB)
----HomeoAnalysis.html(9.17MB)
----construct_igraph_netwrok_homeologs.R(3KB)
----README.md(1KB)
----WGCNA_construction.R(13KB)