文件名称：RNA-seq-workshop：RNA-seq-workshop
文件大小：2.41MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-07 15:21:57
RNA序列工作室 这次RNA-seq研讨会旨在让您开始自己的RNA-seq分析，并假设您已经熟悉bash和R的基础知识。 我们将使用NeSI HPC进行某些分析，因此请确保您拥有NeSI帐户并且能够登录。 浏览讲习班的准备文件，以确保您准备： 研讨会大纲（上午9点至下午4点） RNA序列概述 如何QC一个fastq？ 如何修剪序列文件？ 修整质量 适配器修整 如何使用HISAT2在参考上比对测序读数 创建参考序列 对齐参考上的读数 定义对齐格式 SAMtools简介 如何获得计数矩阵 什么是注释文件 如何使用featureCount 差异基因表达分析（使用DESeq2，edgeR和Limma软件包） 过度陈述分析（基因本体论） 讨论与跟进 出处通知 用于准备研讨会的材料摘自Assoc。 迈克尔·布莱克教授教授Stat435课程。 UC Riverside整合基因组生物学
【文件预览】：
RNA-seq-workshop-master
----3.Mapping_And_Count()
--------README.md(9KB)
----Prep_Files()
--------Images()
--------README.md(2KB)
----1.Quality_Assessment()
--------README.md(5KB)
----4.Differential_Expression()
--------README.md(14KB)
----.gitignore(570B)
----README.md(2KB)
----5.Overrepresentation_Analysis()
--------README.md(15KB)
----2.Trimming_And_Filtering()
--------README.md(3KB)