【文件属性】：
文件名称：RNA-seq-workshop：RNA-seq-workshop
文件大小：2.41MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-15 21:35:17
RNA序列工作室
这次RNA-seq研讨会旨在让您开始自己的RNA-seq分析，并假设您已经熟悉bash和R的基础知识。
我们将使用NeSI HPC进行某些分析，因此请确保您拥有NeSI帐户并且能够登录。
浏览讲习班的准备文件，以确保您准备：
研讨会大纲（上午9点至下午4点）
RNA序列概述
如何QC一个fastq？
如何修剪序列文件？
修整质量
适配器修整
如何使用HISAT2在参考上比对测序读数
创建参考序列
对齐参考上的读数
定义对齐格式
SAMtools简介
如何获得计数矩阵
什么是注释文件
如何使用featureCount
差异基因表达分析（使用DESeq2，edgeR和Limma软件包）
过度陈述分析（基因本体论）
讨论与跟进
出处通知
用于准备研讨会的材料摘自Assoc。 迈克尔·布莱克教授教授Stat435课程。
UC Riverside整合基因组生物学
【文件预览】：
RNA-seq-workshop-master
----3.Mapping_And_Count()
--------README.md(9KB)
----Prep_Files()
--------Images()
--------README.md(2KB)
----1.Quality_Assessment()
--------README.md(5KB)
----4.Differential_Expression()
--------README.md(14KB)
----.gitignore(570B)
----README.md(2KB)
----5.Overrepresentation_Analysis()
--------README.md(15KB)
----2.Trimming_And_Filtering()
--------README.md(3KB)