文件名称:Dory:克服计算持久同源性的障碍
文件大小:2.04MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-23 16:09:39
Python
海ry 克服计算持久同源性的障碍 存储库。 Dory的Python安装 使用pip3 install pydory为Dory安装Python( pip3 install pydory )包装器。 它将需要具有openMP支持的gcc-10.2。 运行python文件pydory_benchmarks.py进行基准测试。 这个包装器的开销很小。 峰值内存使用量和计算时间类似于C源代码。 重现基准 Ripser: ://arxiv.org/abs/2103.05608中的基准是2021年3月22日使用Ripser制作的。此后已进行更新。 我们在此存储库中提供了传统versoin的副本(从3月22日从https://github.com/Ripser/ripser复制)。 我们使用c++ -std=c++11 ripser.cpp -o ripser -O3来编译Ripser。 可以使用p
【文件预览】:
Dory-main
----Benchmarking_codes()
--------pydory_sparse_benchmarks.py(2KB)
--------Ripser_benchmarks.py(2KB)
--------Gudhi_benchmarks.py(3KB)
----LICENSE(1KB)
----Datasets()
--------dragon2000_locs.csv(49KB)
--------fractal_r_distmat.csv(2MB)
--------o3_8192_locs.csv(900KB)
--------torus4_locs.csv(2.41MB)
----README.md(2KB)
----run_pydory.py(1KB)