文件名称：Supertree Tool Kit-开源
文件大小：126KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-05-17 21:21:04
一个Perl模块和一些脚本来帮助处理基于NEXUS的树文件，这些文件准备好在诸如PAUP *之类的程序中构建超级树。
【文件预览】：
Bio-STK-0.1.2
----MANIFEST(2KB)
----_check.cfg(1KB)
----t()
--------tree_contains.t(951B)
--------get_analysis.t(582B)
--------get_characters.t(1KB)
--------pod.t(162B)
--------read_xml_file.t(540B)
--------xml_contains_taxon.t(2KB)
--------get_treefile.t(541B)
--------internal_subs.t(3KB)
--------read_tree_file.t(1KB)
--------data()
--------find_xml_files.t(601B)
--------check_tree_file.t(794B)
--------xml_contains_analysis.t(551B)
--------taxa_from_tree.t(2KB)
--------find_tree_files.t(605B)
--------README(3KB)
--------save_tree_file.t(2KB)
--------get_source_data.t(3KB)
--------tree_equals.t(316B)
--------taxa_from_xml.t(2KB)
--------replace_taxon_xml.t(11KB)
--------save_xml_file.t(1KB)
--------get_short_study_name.t(2KB)
--------Bio-STK.t(464B)
--------contains_fossils.t(1KB)
--------replace_taxon_tree.t(6KB)
--------get_taxa_list.t(4KB)
--------contains_data.t(1KB)
--------xml_contains_character.t(2KB)
----LICENSE(33KB)
----README(1KB)
----Makefile.PL(2KB)
----doc()
--------pod2include.pl(3KB)
--------STK.html(63KB)
--------STK_header.pod(6KB)
----exec()
--------stk_search_data.pl(14KB)
--------stk_check_substitutions.pl(8KB)
--------STK-XML.jar(36KB)
--------stk_amalgamate_trees.pl(8KB)
--------stk_replace_genera.pl(10KB)
--------stk_check_overlap.pl(11KB)
--------stk_tree_permutation.pl(7KB)
--------stk_data_summary.pl(9KB)
--------stk_check_data.pl(14KB)
--------stk_create_matrix.pl(9KB)
--------stk_replace_taxa.pl(12KB)
--------.perltidyrc(590B)
--------stk_fix_treefiles.pl(6KB)
--------stk_data_independence.pl(9KB)
----lib()
--------Bio()
----META.yml(892B)
----Changes(247B)