文件名称:fraser_lab:斯坦福大学生物系弗雷泽实验室常用的脚本和工具
文件大小:28KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-06 06:21:51
Python
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FRASER 实验室脚本的注意事项
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Carlo 最后更新时间为 2015.03.27
BED2FASTA.pl
This script takes an annotation file in BED format as well as a genome in FASTA format and
outputs a new FASTA file containing the sequences of the annotations (e.g., spliced genes).
USAGE: perl BED2FASTA.pl --genome
【文件预览】:
fraser_lab-master
----CountSNPASE.py(17KB)
----readme.md(14KB)
----ConcatenateTables.pl(3KB)
----MaskReferencefromBED.pl(3KB)
----SetFASTARowLength.pl(3KB)
----CountFASTANucs.py(2KB)
----GTF2FASTA.pl(4KB)
----PerformRankedSignTest.pl(9KB)
----GetGeneASE.py(15KB)
----BED2FASTA.pl(3KB)