BALSAMIC:癌症体细胞突变的生物信息学分析管线

时间:2024-03-30 13:35:53
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文件名称:BALSAMIC:癌症体细胞突变的生物信息学分析管线

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更新时间:2024-03-30 13:35:53

bioinformatics genomics variant-calling somatic-mutations snakemake-workflows

癌症中体细胞突变的生物信息学分析管线(v 7.1.1) FastQ到带注释的VCF BALSAMIC基本上是其核心工作流管理器的包装器。 目的是要拥有一个具有明确定义的cli的程序包,以使其可重现,使用户无需依赖工作流管理器即可运行体细胞调用。 目前,BALSAMIC正在使用Snakemake作为其核心。 因此,只要创建了适当的配置文件,就可以使用此软件包和标准Snakemake cli中可用的工作流程来运行示例。 源代码 版本 7.1.1 作者 哈桑·福洛维·阿斯 发展模式 Gitflow 建置状态 容器最新发布状态 集装箱建造类型 容器主状态 代码覆盖率 文献资料 依存关系 贡献者 @ ashwini06,@ mropat,@ imsarath,@ keyvanelhami


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