stability:流感进化过程中稳定和失稳突变的分析

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文件名称：stability:流感进化过程中稳定和失稳突变的分析
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更新时间：2021-05-28 22:00:54
JavaScript 流感进化过程中稳定和失稳突变的分析 管道 运行H3N2_process以获取新序列 从“ augur /”目录中运行augur管道以过滤，对齐，构建树，进行祖先状态重建，注释主干分支和列表序列（尚未为其计算ddG）。 它检查dynamodb中的稳定性表以查看是否已计算出稳定性值。 新序列放在/ stability-data中的new_eq_file.txt中。 python src/H3N2_proccess.py --stop mutations 计算新序列的ddG 将/ stability-data /目录复制到群集上。 将批处理文件和foldx文件更改为可执行文件。 定义AWS键以访问dynamodb中的稳定性表。 chmod 755 stability_sbatch_call.sh cd foldx_essentials/ chmod 755 foldx cd .. so