lipomadsen2015-idss-seriation-paper:提交给PLoS One的IDSS序列化的论文和相关分析

时间:2024-06-01 11:11:53
【文件属性】:

文件名称:lipomadsen2015-idss-seriation-paper:提交给PLoS One的IDSS序列化的论文和相关分析

文件大小:34.58MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-01 11:11:53

TeX

LipoMadsenDunnell 2015 IDSS系列论文 该存储库包含由Carl P. Lipo,Mark E. Madsen和Robert C. Dunnell撰写的论文《确定性频率序列化的理论上足够和计算上实用的技术》的“资源”。 本文介绍了迭代确定性序列化解决方案(IDSS)算法,该算法具有以下功能: 它使用原始伪像类型计数数据执行频率序列化,而不是组合之间的相似性指标。 IDSS查找所有可能的组合顺序,包括仅使用组合子集的有效顺序。 IDSS可以显示所有可能的排序,并使用各种图形加法算法将解决方案叠加为“复合”排序,该排序可能具有许多分支(当组合参与不同的序列化解决方案时可能会发生这种情况)。 该算法结合了自举置信区间计算,用于在给定每个组合的样本大小的情况下确定组合顺序的成对重要性。 在构建排序时使用此CI来确定组装位置是否指示不同的解决方案,或者在给定采样误差的


【文件预览】:
lipomadsen2015-idss-seriation-paper-master
----paper()
--------Fig3.eps(8.93MB)
--------Fig4.png(93KB)
--------Fig4.eps(226KB)
--------Fig9.eps(332KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revised-submission.aux(30KB)
--------Fig2.eps(1.53MB)
--------Fig13.png(1.9MB)
--------Fig6.eps(1.49MB)
--------Fig5.eps(386KB)
--------Fig9.png(172KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revision-AUTOGENERATED.tex(0B)
--------Fig2.svg-g10371-172.png(113KB)
--------Fig2.svg-image14017-370.png(127KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revised-submission.tex(99KB)
--------CopyrightReleaseMemo.pdf(110KB)
--------Fig8.eps(554KB)
--------Fig13.eps(3.63MB)
--------Fig10.png(1.45MB)
--------Fig6.png(500KB)
--------Fig2.png(465KB)
--------Fig8.png(298KB)
--------S1Text.tex(3KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revised-submission.fdb_latexmk(15KB)
--------PLOS-Submission.eps(277KB)
--------Fig3.png(1.42MB)
--------Fig12.png(322KB)
--------Fig1.png(156KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-TRACKCHANGES.pdf(349KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revised-submission.fls(15KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revised-submission.log(44KB)
--------Makefile(697B)
--------Fig5.png(124KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-original-submission.tex(83KB)
--------PONE-D-14-58582-Revision.pdf(6.41MB)
--------Fig10.eps(4.89MB)
--------Illustrator_Versions()
--------Fig12.eps(79KB)
--------flowRoot29319.png(8KB)
--------Fig1.eps(720KB)
--------Fig11.png(2.04MB)
--------flowRoot29319-0-4.png(203KB)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revised-submission.out(0B)
--------lipomadsendunnell2015-idss-seriation-revised-submission.pdf(239KB)
--------Fig11.eps(3.77MB)
--------Fig7.png(256KB)
--------PLOS-submission-eps-converted-to.pdf(15KB)
--------Fig7.eps(896KB)
----seriation-analysis()
--------pfgXY.txt(3KB)
--------Makefile(251B)
--------pfg-cpl.txt(818B)
----ca-analysis()
--------Rplots.pdf(13KB)
--------.p()
--------CAseriation.xlsx(7KB)
--------CAseriation_rows_clust.xlsx(4KB)
--------Rplots1.pdf(5KB)
--------Makefile(58B)
--------data()
--------CAseriation.r(3KB)
----LICENSE(11KB)
----README.md(3KB)
----.gitignore(146B)

网友评论