文件名称：configs:配置文件，用于定义特定于不同机构的计算环境的参数
文件大小：230KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-06 09:15:49
bioinformatics nextflow configuration pipelines workflows
用于托管Nextflow配置文件的存储库，该文件包含在不同机构运行nf-core管道所需的自定义参数。 目录 创建特定于管道的nf-core/configs文件 帮助 使用现有配置 Nextflow -c参数可以与nf-core管道一起使用，以加载本地可用的自定义配置文件。 但是，如果您或组织中的其他人可能定期运行nf-core管道，则最好使用/创建一个自定义配置文件来定义组织内计算环境所特有的一些通用设置，这是一个好主意。 配置和参数 存储在此存储库中的配置文件定义了一组参数，这些参数特定于不同机构的计算环境，但通用性足以与所有nf-core管道一起使用。 所有nf核心管道都继承了Nextflow提供的功能，因此自定义配置文件可以包含可用于两者的参数/定义。 例如，如果您能够在HPC上使用奇异性，则可以在配置文件中添加和自定义Nextflow singularity作用域。 同样，