文件名称:overlapy:结构生物信息学和Python学科项目(生物信息学硕士)
文件大小:1.13MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-08 10:40:49
TeX
重叠 结构生物信息学和 Python 学科项目(健康科学生物信息学硕士 - ); 由 Álvaro Abella Bascarán、Josep Arús Pous 和 Samuel Miravet Verde 开发。 什么是重叠? Overlapy 是一个 python 库和命令行工具,它提供了一种简单的方法来进行蛋白质叠加。 Overlapy 还以一种更加用户友好的方式提供,作为一个。 如果您有兴趣了解有关该程序的更多信息、其实现和几个使用示例,请阅读我们的(您必须将其作为原始数据以 pdb 格式下载)。 安装 重叠使用python3。 请检查它是否已安装: python3 --version 如果不是,请安装它。 sudo apt-get install python3.4 为了让 Overlapy 工作,你必须首先满足一些库要求。 首选方法是为此使用 pip: sud
【文件预览】:
overlapy-master
----pdbs()
--------1SBH.pdb(192KB)
--------3TRX.pdb(146KB)
--------1XWC.pdb(96KB)
--------1SCJ.pdb(252KB)
--------1ABI.pdb(269KB)
--------1ABJ.pdb(248KB)
----bin()
--------overlapy(93B)
----LICENSE(1KB)
----report()
--------images()
--------overlapy_report.pdf(470KB)
--------.gitignore(25B)
--------overlapy_report.tex(29KB)
----requirements.txt(29B)
----setup.py(630B)
----.gitignore(702B)
----overlapy()
--------__init__.py(0B)
--------needleman.py(5KB)
--------superimposer.py(12KB)
--------cmd.py(4KB)
----README.md(3KB)