【文件属性】：
文件名称：nxfvars:从python脚本或笔记本访问nextflow变量
文件大小：13KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-04-11 00:20:03
Python
Nxfvars：Nextflow的参数化笔记本
Nxfvars使您可以轻松地从Nextflow进程参数化Jupyter笔记本，Rmarkdown笔记本或纯Python脚本。 可以在笔记本中直接使用在进程的脚本部分中可访问的所有变量。
在Nextflow管道中使用nxfvars
下载并将脚本添加到您的管道中。 导入nxfvars函数，并从流程的脚本部分调用它：
nextflow.enable.dsl = 2
import { nxfvars } from "./nxfvars.nf"
process foo {
script:
"""
${nxfvars(task)}
# run script or execute notebook here
"""
}
执行该过程后，nxfvars在工作目录中生成一个.params.yml文件。 它包含可以在脚
【文件预览】：
nxfvars-main
----README.rst(4KB)
----.github()
--------workflows()
----examples()
--------nxfvars_python_script()
--------.gitignore(15B)
----LICENSE(1KB)
----lang()
--------Python()
--------nextflow()
----.gitignore(2KB)