文件名称：nxfvars:从python脚本或笔记本访问nextflow变量
文件大小：13KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-30 18:06:43
Python
Nxfvars：Nextflow的参数化笔记本 Nxfvars使您可以轻松地从Nextflow进程参数化Jupyter笔记本，Rmarkdown笔记本或纯Python脚本。 可以在笔记本中直接使用在进程的脚本部分中可访问的所有变量。 在Nextflow管道中使用nxfvars 下载并将脚本添加到您的管道中。 导入nxfvars函数，并从流程的脚本部分调用它： nextflow.enable.dsl = 2 import { nxfvars } from "./nxfvars.nf" process foo { script: """ ${nxfvars(task)} # run script or execute notebook here """ } 执行该过程后，nxfvars在工作目录中生成一个.params.yml文件。 它包含可以在脚
【文件预览】：
nxfvars-main
----README.rst(4KB)
----.github()
--------workflows()
----examples()
--------nxfvars_python_script()
--------.gitignore(15B)
----LICENSE(1KB)
----lang()
--------Python()
--------nextflow()
----.gitignore(2KB)