文件名称：Circall:Circall是一种从配对末端RNA测序数据中发现环状RNA的新颖方法
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更新时间：2024-04-20 09:37:23
C++
Circall版本0.0.0的文档 ################################################ ######### 最新消息 2020年5月30日：版本0.0.0 首次提交 1.简介 Circall是一种从配对末端RNA测序数据中发现环状RNA的新颖方法。 Circall的特点是采用准映射进行快速准确的比对，并采用多维局部错误发现方法进行circRNA候选评估，从而提高了circRNA检测的准确性。 方法出版物中描述了该方法的全部详细信息。 软件要求： Circall用R和C ++实现。 我们承认来自Sailfish，Rapmap和该软件中使用的其他工具的材料。 GCC的C ++-11兼容编译器版本（g ++> = 4.8.2） R软件包版本3.6.0或更高版本，并带有以下已安装的软件包：GenomicFeatures，Biostrings，f
【文件预览】：
Circall-master
----config.sh(247B)
----Circall.sh(12KB)
----include()
--------ReadExperiment.hpp(9KB)
--------EquivalenceClassBuilder.hpp(5KB)
--------ExportFeq.hpp(937B)
--------EmpiricalDistribution.hpp(2KB)
--------spdlog()
--------SACollectorCircall.hpp(26KB)
----.DS_Store(6KB)
----install.sh(1KB)
----src()
--------EmpiricalDistribution.cpp(4KB)
--------ExportFeq.cpp(5KB)
--------Circall_pseudo.cpp(64KB)
--------CMakeLists.txt(15KB)
--------Circall_wt.cpp(72KB)
--------TxIndexer.cpp(9KB)
--------Circall_bsj.cpp(69KB)
----R()
--------doSingleEndFiltering.R(1KB)
--------export.R(790B)
--------getFdr.R(440B)
--------Circall_functions.R(32KB)
--------doPairEndFiltering.R(2KB)
--------createSqlite.R(586B)
--------getPseudoCircRNAsequence.R(5KB)
--------load_packages.R(1KB)
--------buildBSJdb.R(10KB)
--------Circall_simulator.R(18KB)
----README.md(15KB)
----Data()
--------Circall_depdata_human.RData(87KB)