文件名称：再测序DNA微阵列的等长变覆盖探针设计方法 (2004年)
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更新时间：2024-06-15 19:48:45
自然科学 论文
针对再测序DNA微阵列的寡核苷酸探针设计，提出了2种等长变覆盖的方法：①基于Tm距离的探针优化方法，从冗余探针集中逐步删除具有最大Tm距离的探针；②应用遗传算法，将候选探针集编码为染色体，通过选择、交叉和变异等遗传操作得到最大适应度的探针集。这2种方法，都能在探针长度相等的情况下，通过改变相邻探针之间的覆盖度使探针的Tm值尽可能保持一致。实验结果表明：等长变覆盖法得到的探针集整体优于等长移位法和变长变覆盖法的结果，具有更好的杂交条件一致性。