文件名称:IMPACT-开源
文件大小:378.48MB
文件格式:GZ
更新时间:2024-05-17 19:14:22
开源软件
IMPACT是用于ChIP-Seq数据的集成式多读取峰调用工具。 IMPACT在调用峰中利用了多次读取,并为用户提供了高置信度的峰。 此外,IMPACT提供了一个完全集成的管道,可产生下游分析结果,例如基序发现和峰-基因注释。
【文件预览】:
impact_v1.0
----impact.sh(29KB)
----tools()
--------bedtools-2.17.0()
--------sratoolkit.2.3.4-2()
--------comparative_analysis()
--------AREM-1.0.1()
--------bowtie-1.0.0()
--------csem-2.4()
--------samtools-0.1.19()
--------peak_refinement()
--------mosaics()
--------downstream_analysis()
--------preprocessing()
--------fastx_toolkit_0.0.13()
--------lonut()
----INSTALL(3KB)