IMPACT-开源

时间:2024-05-17 19:14:22
【文件属性】:

文件名称:IMPACT-开源

文件大小:378.48MB

文件格式:GZ

更新时间:2024-05-17 19:14:22

开源软件

IMPACT是用于ChIP-Seq数据的集成式多读取峰调用工具。 IMPACT在调用峰中利用了多次读取,并为用户提供了高置信度的峰。 此外,IMPACT提供了一个完全集成的管道,可产生下游分析结果,例如基序发现和峰-基因注释。


【文件预览】:
impact_v1.0
----impact.sh(29KB)
----tools()
--------bedtools-2.17.0()
--------sratoolkit.2.3.4-2()
--------comparative_analysis()
--------AREM-1.0.1()
--------bowtie-1.0.0()
--------csem-2.4()
--------samtools-0.1.19()
--------peak_refinement()
--------mosaics()
--------downstream_analysis()
--------preprocessing()
--------fastx_toolkit_0.0.13()
--------lonut()
----INSTALL(3KB)

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