STARS - sequence typing-开源

时间:2024-05-18 03:04:20
【文件属性】:

文件名称:STARS - sequence typing-开源

文件大小:38KB

文件格式:GZ

更新时间:2024-05-18 03:04:20

开源软件

STARS是staden的替代界面,用于通过批处理,手动编辑,迹线查看和数据管理来研究短序列中的多态性。 STARS最初设计用于细菌的多基因座序列分型。


【文件预览】:
stars-1.2a
----check-sequences2002(3KB)
----help5(3KB)
----batch1.config2001(1KB)
----contig-editor(2KB)
----setup.bak(15KB)
----run(6KB)
----check-sequences(3KB)
----help2(2KB)
----help4(2KB)
----calc-cons2000(2KB)
----stars(2KB)
----clean-interface.tcl(5KB)
----adminhelp(4KB)
----help0(1KB)
----batch1.config2000(1KB)
----checkall-dbs(2KB)
----starsbatchqry.pl(2KB)
----mlrecover(2KB)
----setup.tcl(15KB)
----mlst.tcl(36KB)
----help3(5KB)
----cleaner-script(3KB)
----calc-cons99(2KB)
----delete-contig(2KB)
----check-sequences2001(3KB)
----locusfile.pm(4KB)
----single-consensus(2KB)
----batch1.config(1KB)
----mlst.bak(36KB)
----pregap-db(1010B)
----help1(3KB)
----complement-contig(1KB)
----readme.txt(1KB)
----sort-mlst-staden(3KB)
----calc-cons(2KB)

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