文件名称:高飞
文件大小:9.54MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-02 17:44:39
Python
更新:我最近做了一个快速更新。 我个人一直在使用GOPY来生成PDB文件,然后将其导入xleap / AmberTools。 对于氧化石墨烯(GO),环氧基包含两个碳原子,在GOPY中均使用相同的名称“ CY”。 我最近发现,给第二个使用不同的名称会更好,因此现在将第二个命名为“ CZ”。 如果您希望它们都为“ CY”,请更改代码或打开文本编辑器,然后将所有“ CZ”更改为“ CY”。 稍后,我将对此进行完善(检查错误等)。 我这样做是因为当我使用xleap时,我为石墨烯原子,COOH残基,环氧残基和羟基残基定义了一个lib文件,并且“ bondbydistance”命令以这种方式更好地工作。 如果您需要帮助,有任何疑问或正在寻求合作,请给我发 。 我愿意帮忙! 另外,请通过以下检查我的researchgate个人资料: : 。 !!!重要提示:如果您在第2377行遇到错误,请尝试添
【文件预览】:
GOPY-master
----Examples()
--------rGO_PEG_NH2()
--------GO()
--------Ndoped()
--------PG()
----GOPY_COO.py(129KB)
----wast2.png(8.76MB)
----README.md(5KB)
----GOPY.py(130KB)