Alignment and assembly free-开源

时间:2024-06-16 00:44:08
【文件属性】:

文件名称:Alignment and assembly free-开源

文件大小:2.63MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-16 00:44:08

开源软件

这是AAF最初发布的地方。 有关最新更新,请转到下面指示的主页。 它在GitHub上,因此更容易报告错误。 感谢您选择AAF,如果有任何疑问或问题,请在我的Github页面上发表评论。


【文件预览】:
AAF
----aaf_tip.py(4KB)
----parametric_bootstrap.R(7KB)
----data()
--------sp4()
--------sp9()
--------sp10()
--------sp3()
--------sp1()
--------sp5()
--------sp8()
--------sp2()
--------sp7()
--------sp6()
----phylip_src()
--------phylip.h(24KB)
--------COPYRIGHT(1KB)
--------Makefile(998B)
--------.DS_Store(6KB)
--------dist.h(1KB)
--------cons.c(40KB)
--------cons.h(2KB)
--------dist_long.c(13KB)
--------dist.c(13KB)
--------fitch_kmerX_long.c(30KB)
--------consense.c(10KB)
--------fitch_kmerX.c(30KB)
--------phylip.c(82KB)
--------README(331B)
--------treedist.c(38KB)
----.DS_Store(10KB)
----test_nshare.csv(637B)
----aaf_distance.py(8KB)
----COPYING(34KB)
----utils()
--------pkdat2hist.py(2KB)
--------phVSk.R(2KB)
--------gc.py(1KB)
----aafUserManual.pdf(232KB)
----VersionControl.txt(710B)
----tip_info_test.txt(208B)
----aaf_phylokmer.py(8KB)
----phylokmer()
--------Makefile(672B)
--------kmer_count.c(13KB)
--------file_reader.c(10KB)
--------vector.h(5KB)
--------kmer_countx.c(15KB)
--------filter.c(14KB)
--------hashset.h(24KB)
--------string.h(6KB)
--------file_reader.h(5KB)
----nonparametric_bootstrap_s2only.py(9KB)
----nonparametric_bootstrap.py(19KB)

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