AppliedGenomics2021:2021年Spring应用基因组学课程材料

时间:2021-02-25 10:21:23
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文件名称:AppliedGenomics2021:2021年Spring应用基因组学课程材料
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更新时间:2021-02-25 10:21:23
JHU EN.601.749:计算基因组学:应用比较基因组学 教授: (mschatz @ cs.jhu.edu) TA: (arun.das @ jhu.edu) 上课时间:星期一+星期三@ 1:30p-2:45p(缩放)(有关链接,请参见) 沙茨办公时间:预约办公时间:星期一12-1pm,需要预约 本课程的主要目标是使学生具有理论基础,并让该课程有权进行独立的基因组分析。 我们将研究从原始测序数据开始的用于比较和分析基因组的领先计算和定量方法。 该课程将侧重于人类基因组学和人类医学应用,但是这些技术将广泛应用于生命之树。 主题将包括基因组组装和比较基因组学,变体鉴定与分析,基因表达与调控,个人基因组分析以及癌症基因组学。 评分将基于作业,期中考试,课堂演示和重要的课堂项目。 没有正式的课程前提条件,尽管该课程要求熟悉UNIX脚本和/或编程才能完成作业和课程项目。 先决条件 在线介绍
【文件预览】:
appliedgenomics2021-master
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----lectures()
--------09.readmapping.pdf(5.99MB)
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--------01.Introduction.pdf(7.9MB)
--------05.WholeGenomeAlignment.pdf(6.05MB)
--------03.GenomeAssembly.pdf(8.56MB)
--------07.longreadassembly.pdf(6.37MB)
--------06.humangenome.pdf(8.52MB)
--------10.variantcalling.pdf(6.47MB)
--------04.assembly2.pdf(8.05MB)
----policies()
--------Syllabus.pdf(137KB)
--------README.md(16B)
--------Syllabus.docx(94KB)

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