【文件属性】:
文件名称:ml-in-genomics-2021:“基因组学ML”课程的课程材料
文件大小:9.56MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-04-02 06:07:56
JupyterNotebook
2021-ml基因组学
“基因组学机器学习”课程的课程材料。
包括演讲幻灯片和实践会议的Jupyter笔记本。
安装
克隆存储库
git clone https://github.com/goepp/ml-in-genomics-2021/
您需要在沉重的文件athaliana_small.X.txt和athaliana_small.W.txt并将其放置在athaliana_small.W.txt practical/data/ 。
入门
实际会议必须在jupyter notebook 。 脚本需要使用seaborn , pandas , numpy , sklearn和matplotlib 。
在本地计算机上,您可以创建一个conda环境,安装上述模块,然后从该环境中运行jupyter Notebook。
【文件预览】:
ml-in-genomics-2021-master
----.gitignore(191B)
----README.md(789B)
----LICENSE(1KB)
----practical()
--------practical2_corrected.ipynb(239KB)
--------model_nclasso.obj(35.82MB)
--------practical1.ipynb(282KB)
--------practical1_corrected.ipynb(217KB)
--------practical2.ipynb(126KB)
--------data()
--------data_pre_processing.ipynb(79KB)
----slides()
--------main.pdf(6.7MB)