文件名称：ROKU:鉴定组织特异性基因的方法
文件大小：19KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-01 06:00:36
R
ROKU ROKU 的 R 实现，一种用于识别组织特异性基因的方法。 该方法的详细信息描述于： Kadota, K., Ye, J., Nakai, Y., Terada, T., Shimizu, K., 2006. 。 BMC 生物信息学 7, 294。 免责声明 这个包是作为个人练习编写的，用于练习在 R 中实现已发布的算法，并立即学习创建 R 包。 虽然已做出一些努力来确保算法的准确性，但该软件包尚未经过彻底测试和记录。 使用风险自负（请参阅）。 依赖关系 ROKU使用affy包，它可以从Bioconductor的安装： source( " http://bioconductor.org/biocLite.R " ) biocLite( " affy " ) 安装 install.packages( " devtools " ) devtools :: install_g
【文件预览】：
ROKU-master
----README.Rmd(1KB)
----ROKU.Rproj(335B)
----man()
--------u_statistic.Rd(1KB)
--------ROKU_as_df.Rd(535B)
--------ROKU.Rd(1KB)
--------psidata.Rd(308B)
--------build_outlier_combinations.Rd(622B)
--------preprocess_with_tukey.Rd(651B)
--------find_tissue_outliers.Rd(2KB)
--------filter_outliers.Rd(562B)
----data()
--------psidata.rda(846B)
----NAMESPACE(314B)
----tests()
--------testthat()
--------run_tests.R(75B)
----LICENSE(1KB)
----.Rbuildignore(74B)
----.gitignore(29B)
----R()
--------u_statistic.R(1KB)
--------build_outlier_combinations.R(1019B)
--------data.R(240B)
--------ROKU-package.r(50B)
--------entropy_shannon.R(268B)
--------preprocess_with_tukey.R(675B)
--------find_tissue_outliers.R(3KB)
--------filter_outliers.R(876B)
--------ROKU.R(4KB)
----DESCRIPTION(490B)
----README.md(3KB)