文件名称：pipelines:用于集群的生物信息学管道
文件大小：52KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-09 23:14:47
Shell
管道 在 Linux 集群上使用的令人敬畏的生物信息学管道
【文件预览】：
pipelines-master
----ExtractRegion()
--------extractRegionFromBam.sh(4KB)
----DimensionalityReductionFromSparseMatrix()
--------TruncatedSVDplot.py(9KB)
--------NFMplot.py(12KB)
----tools()
--------calculate_checksums.sh(1KB)
--------rezip.sh(889B)
----HiC()
--------config_example.sh(711B)
--------run_HiC.sh(3KB)
----MappabilityWithGem()
--------makeMappability.sh(986B)
----cronjobs(172B)
----Chromablocks()
--------chromablocks.R(1KB)
--------runChromablocks.sh(5KB)
----Annotations()
--------getCpG.sh(2KB)
--------getRepeats.sh(1KB)
----SubsampleFastq()
--------subsample.sh(2KB)
----GEM()
--------makeMappability.sh(2KB)
----.gitignore(11B)
----ChIP-QC()
--------CHANCE()
--------aggregate.sh(5KB)
--------NCIS()
----README.md(84B)
----segway()
--------config_example.sh(2KB)
--------Readme.txt(1KB)
--------bak()
--------run_segway.sh(22KB)
--------.DS_Store(6KB)
----hiclib()
--------run_hiclib.py(11KB)