生物模拟器:支持标准命令行界面的容器化生物模拟工具的注册表

时间:2021-02-14 10:42:14
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文件名称:生物模拟器:支持标准命令行界面的容器化生物模拟工具的注册表
文件大小:13KB
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更新时间:2021-02-14 10:42:14
docker simulation systems-biology computational-biology reuse 生物模拟器 更全面,更具预测性的模型具有促进生物学,生物工程和医学发展的潜力。 建立更多的预测模型可能需要许多研究人员的共同努力。 这要求团队能够共享和重用模型组件和模拟。 尽管为开发诸如 , 和标准巨大的努力,但仍然很难重用许多模型和仿真。 重用模型和仿真的挑战之一是各种不兼容的建模格式和仿真工具。 通过提供一组仿真工具来应对这一挑战,其中许多工具提供了一致的界面。 这些标准化的仿真工具使查找和运行仿真更加容易。 这些标准化的仿真工具基于BioSimulators的以下标准:仿真工具的命令行界面,仿真工具的Docker映像的标准结构以及捕获仿真工具功能(例如,支持建模框架,仿真算法,建模格式)的格式。 BioSimulators网站提供了一个用于浏览此注册表的Web应用程序。 该网站提供了指向各个模拟器及其容器的链接。 有关使用容器的说明,请访问 。 也提供了有关如何容器化仿真工具并
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Biosimulators-dev
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----.github()
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