【文件属性】:
文件名称:生物模拟器_iBioSim
文件大小:23.62MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-02-08 13:33:49
Python
生物模拟器_iBioSim
符合模拟程序的命令行界面。
内容
安装
安装Docker映像
docker pull paytonco/ibiosim
当地使用
usage: iBioSim [-h] [-d] [-q] -i ARCHIVE [-o OUT_DIR] [--directory DIRECTORY]
[-p PROPERTIES] [-ti INITTIME] [-tl LIMTIME] [-ot OUTTIME]
[-pi PRINTINTERVAL] [-m0 MINSTEP] [-m1 MAXSTEP] [-aErr ABSERR]
[-sErr RELERR] [-sd SEED] [-r RUNS] [-sim SIMULATION] [-v]
BioSimulatiors-c
【文件预览】:
Biosimulators_iBioSim-master
----MANIFEST.in(135B)
----Dockerfile(2KB)
----requirements.txt(29B)
----CONTRIBUTING.md(3KB)
----LICENSE(11KB)
----biosimulators.json(6KB)
----setup.cfg(28B)
----Dependencies()
--------GeneNet.tar.gz(330KB)
--------libSBML-5.15.2-core-plus-packages-src.tar.gz(14.26MB)
--------newbuild.sh(875B)
--------gsl-latest.tar.gz(5.64MB)
--------reb2sac.tar.gz(8.03MB)
----setup.py(2KB)
----README.md(3KB)
----requirements.optional.txt(50B)
----Biosimulators_iBioSim()
--------_version.py(21B)
--------__init__.py(123B)
--------__main__.py(4KB)
--------core.py(2KB)
----tests()
--------fixtures()
--------requirements.txt(16B)
--------test_all.py(4KB)
----CODE_OF_CONDUCT.md(5KB)
----.gitignore(30B)