Vancouver Short Read Analysis Package-开源

时间:2024-05-18 13:12:57
【文件属性】:

文件名称:Vancouver Short Read Analysis Package-开源

文件大小:10.4MB

文件格式:GZ

更新时间:2024-05-18 13:12:57

开源软件

该软件包包含用于短读DNA测序技术的代码,并且包括用于ChIP-Seq,完整转录组Shot弹枪测序,完整基因组Shot弹枪测序,SNP检测,转录表达和文件转换的软件包。


【文件预览】:
Changelog.txt
utilities
----TwoWayVenn.jar(17KB)
----AlignSlice.jar(31KB)
----QualityReport.jar(66KB)
conversion_util
----ConvertToBed.jar(289KB)
----BowtieToBedFormat.jar(40KB)
----MaqPetToBed.jar(41KB)
----ConvertToAce.jar(283KB)
release_notes.txt
findfeatures
----FindFeatures.jar(1.59MB)
----RegionToAberations.jar(1.59MB)
fp4
----p53.map(166B)
----SeparateReads.jar(276KB)
----SortFiles.jar(270KB)
----22.test.eland(36KB)
----FindPeaks.jar(422KB)
transcripter
----p53.map(166B)
----PSNPAnalysisPipeline.jar(1.91MB)
----SNPAnalysis.jar(1.62MB)
----GenomicAlignmentAnalysis.jar(1.64MB)
----TranscriptBiasAnalysis.jar(981KB)
----22.test.eland(36KB)

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