采用伪氨基酸组成预测水解酶亚家族 (2010年)

时间:2021-06-12 06:08:22
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文件名称:采用伪氨基酸组成预测水解酶亚家族 (2010年)
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更新时间:2021-06-12 06:08:22
自然科学 论文 利用伪氨基酸组成提取蛋白序列特征值,考察参数λ和 w对识别效果的影响,以 k-近邻作为基础分类器,用于预测水解酶的亚家族类型。结果表明,伪氨基酸组成特征提取法与单纯的20个氨基酸组成特征方法相比,其识别精度有较大程度提高。20AA组成的平均预测精度为72。3%,而伪氨基酸组成特征提取的识别效果可达82.7%。在参数影响考察方面,自相关性函数个数的选取对识别效果影响较大,而权重因子 w对识别效果影响则很小。

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