【文件属性】：
文件名称：coatli:“站点频谱”的二阶和三阶矩。-开源
文件大小：46KB
文件格式：GZ
更新时间：2021-05-31 19:46:28
开源软件
在群体遗传学中，“位点频谱”是对齐 DNA 序列变异的重要汇总统计量。 该软件包包含用于分析计算该光谱的预期二阶和三阶矩的已实现算法（在标准中性 Wright-Fisher 模型下）。 此外，还有一些实用程序可以从聚结模拟中估计这些数量（使用程序“ms”的输出，由 RR Hudson 编写）。 作为附加组件，包含了一些小实用程序来操作和绘制来自 'ms' 的输出。
【文件预览】：
coatli-1.0.6
----M2fs.cpp(3KB)
----nt2mom.cpp(6KB)
----libsequenceMsScan.cpp(2KB)
----ms2SF.cpp(4KB)
----tree2tikz.cpp(4KB)
----m2elsum.cpp(2KB)
----tikzdef.h(71B)
----xi3mom.cpp(8KB)
----mscond.cpp(5KB)
----matmean.cpp(3KB)
----COPYING(34KB)
----msScan.cpp(3KB)
----xit2.cpp(7KB)
----mscondfs.cpp(4KB)
----ms2fastphase.cpp(5KB)
----Node.h(949B)
----mscut.cpp(2KB)
----INSTALL(370B)
----ximom.cpp(6KB)
----ms2tikzhaplo.cpp(7KB)
----m3IO.cpp(3KB)
----msTsub.cpp(5KB)
----mssub.cpp(4KB)
----m3elsum.cpp(2KB)
----colmean.cpp(2KB)
----fold.cpp(2KB)
----ntdef.h(357B)
----ms2tikztree.cpp(4KB)
----condfsOutput.cpp(3KB)
----README.txt(1KB)
----Makefile(3KB)
----parseNewick.cpp(3KB)
----newicksubtree.cpp(2KB)
----m2IO.cpp(2KB)
----nt3mom.cpp(6KB)
----fs3mom.cpp(4KB)
----m3diff.cpp(3KB)
----xit3_slow.cpp(6KB)
----msM2fs.cpp(2KB)
----mscondfsCalc.cpp(4KB)
----ms2vcf.cpp(5KB)
----Smom.cpp(3KB)
----m2diff.cpp(3KB)
----msfs.cpp(2KB)
----testbias.cpp(6KB)
----ms2loci.cpp(2KB)
----Nt3mom.m(12KB)
----xit3.cpp(6KB)
----xit1.cpp(1KB)