est-sfs:估计展开的站点频谱和祖先状态-开源

时间:2021-06-28 23:02:53
【文件属性】:
文件名称:est-sfs:估计展开的站点频谱和祖先状态-开源
文件大小:194KB
文件格式:GZ
更新时间:2021-06-28 23:02:53
开源软件 est-sfs 使用最大似然方法来推断未折叠位点频谱 (uSFS) 和 DNA 序列数据的祖先状态概率。 uSFS 是对来自群体的基因拷贝样本中具有 x 衍生等位基因拷贝的核苷酸位点计数的载体。 est-sfs 使用来自多达三个外群物种的信息推断焦点物种多态位点的 uSFS 和祖先状态概率。 已经实施了三种核苷酸替代模型。 有关该方法的详细信息,请参见 Keightley 和 Jackson,Genetics 209:897-906 (2018)。
【文件预览】:
est-sfs-release-2.03
----config-JC.txt(31B)
----est-sfs-documentation.pdf(186KB)
----seedfile.txt(9B)
----est-sfs.c(48KB)
----routine-library.h(1KB)
----Makefile(141B)
----config-rate6.txt(32B)
----routine-library.c(3KB)
----TEST-DATA.TXT(2KB)
----README(56B)
----config-kimura.txt(31B)

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