文件名称：svdetectcnv.sh:运行 SVDetect 并调整基线的 shell 脚本-开源
文件大小：604KB
文件格式：GZ
更新时间：2024-06-21 10:26:28
开源软件
svdetectcnv.sh 是一个运行 SVDetect CNV 模式的 shell 脚本。 除了 SVDetect 的原始输出之外，该脚本还输出一个调整后的 Bed.graph，其中基线调整为某个染色体或所有染色体的平均 Log2Ratio，以及一个排序的密度文件。 **更新*** 新版本使用exome_test.sh产生的分裂bam，并允许多线程分裂bam。
【文件预览】：
SVDetect_r0.8b
----CHANGES(3KB)
----bin()
--------SVDetect(123KB)
----test_sample()
--------Neuroblastoma()
----scripts()
--------BAM_preprocessingPairs.pl(9KB)
----lib()
--------Parallel()
--------Tie()
----README(27KB)