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文件名称：论文研究-Motif识别算法简介及软件性能研究.pdf
文件大小：233KB
文件格式：PDF
更新时间：2022-08-11 12:57:57
Motif,Wordup,MM,Gibbs采样
Motif在转录和后转录水平的基因表达调控中起着重要的作用。目前，识别Motif的算法和相应的软件已有不少，但是却鲜有对各种算法及软件性能共同评测的研究和报告。介绍了算法的分类以及三种常见的Motif识别算法Wordup，MM和Gibbs采样，并对AlignACE，MEME，MotifSampler，Weeder等13种Motif寻找软件进行性能比较分析。通过生物学意义的研究和性能比较结果可以得出：由于唯有Weeder算法考虑了Motif保守核心位置，因而它在各种软件中识别效果较好；大部分算法只考虑简单而