文件名称:MetaboDIA:MetaboDIA:使用 DIA-MS 进行定量代谢组学分析-开源
文件大小:284KB
文件格式:GZ
更新时间:2024-07-18 13:17:41
开源软件
该包已重新实现为 MetaboKit。 请访问 https://github.com/MetaboKit/MetaboKit
【文件预览】:
MetaboDIA
----NAMESPACE(67B)
----R()
--------out_library.R(2KB)
--------out_ms2.R(4KB)
--------runDBsearch.R(2KB)
--------compare_ms2.R(1KB)
--------mclapply_hack.R(2KB)
--------readmetab_DDA_2.R(2KB)
--------read_mzxml.R(881B)
--------consensus.R(2KB)
--------read_mgf.R(2KB)
--------convert_cam_output.R(1KB)
--------MS1_extraction.R(7KB)
--------DDA_DIA_workflow.R(28KB)
--------readmetab_DDA.R(4KB)
--------readmetab_DIA.R(4KB)
--------read_mono_2.R(1KB)
--------clean_ms2.R(806B)
--------DDA_library_building.R(18KB)
--------read_mono.R(4KB)
--------RT_align.R(3KB)
--------DIA_DIA_workflow.R(18KB)
--------runCAMERA.DBsearch.R(3KB)
--------de_isotope.R(1KB)
--------DDA_DIA_MS2.R(7KB)
--------out_ms1.R(2KB)
----man()
--------isobar_cluster.Rd(1KB)
--------compare_ms2.Rd(1KB)
--------consensus.Rd(2KB)
--------DDA_DIA_workflow.Rd(5KB)
--------read_mgf.Rd(1KB)
--------RT_align.Rd(1KB)
--------readmetab_DIA.Rd(3KB)
--------de_isotope.Rd(1KB)
--------DIA_DIA_workflow.Rd(5KB)
--------DDA_DIA_ms2.Rd(2KB)
--------read_mzxml.Rd(1KB)
--------read_mono.Rd(2KB)
--------mclapply.hack.Rd(1KB)
--------runCAMERA.DBsearch.Rd(2KB)
--------read_mono_2.Rd(1KB)
--------runDBsearch.Rd(2KB)
--------DDA_library_building.Rd(4KB)
--------convert.camera.output.Rd(1KB)
--------MS1_extraction.Rd(2KB)
--------out_ms1.Rd(2KB)
--------MetaboDIA.Rd(2KB)
--------out_ms2.Rd(2KB)
--------clean_ms2.Rd(2KB)
--------readmetab_DDA_2.Rd(2KB)
--------out_library.Rd(1KB)
--------readmetab_DDA.Rd(3KB)
----metaboDIA.pdf(220KB)
----workflow.pdf(32KB)
----metaboDIA.Rmd(12KB)
----DESCRIPTION(2KB)